随着社会的发展和时代的进步，涉及老百姓日常生活的医疗事业改革也在不断深入，这推动了医疗卫生事业的发展，同时也使得医院的管理者逐渐意识到医疗行业财务内部控制的重要性，这在一定程度上推动医疗行业财务内部控制的复杂程度。
一、医院财务内部控制中的主要问题
（一）管理意识的问题
医院的财务内部控制缺乏相应的管理制度很容易形成医院的财务管理混乱，现阶段的医院财务内部控制很多还都是使用的传统管理模式，即按经验管理。依靠医院管理者的指挥和要求来完成财务管理，而这种管理方法已经落后于现代财务管理。同时，还缺乏相应的具体管理措施，导致医院内部控制流于形式化，内部控制大多都只是完成一定的书面文件，且控制制度的执行力度不强，容易在工作的过程中出现漏洞，给医院带来很大的经济损失。
（二）财务预算问题
卫生系统预算的编制是非常严谨的，但现行我国的很多医疗机构都存在着预算超支情况，这主要就是因为设备的引进和职工的待遇造成的财务问题，医院的财务预算主要就是医疗设备的引进和更换，在实际的操作过程中，设备的价格是随市场而波动的，这就给财务预算带来了一定的困难。医院增加内部控制系统的环节越多，不可避免的就会为医院造成成本增加，而这些情况都会给医院的财务控制带来不稳定的问题，造成成本核算问题。
（三）财务人员的工作意识不健全，内部控制落后
在现行的医院财务内部控制中，很多财务人员对国家颁布的会计制度、会计准则和税法对生产成本的列支范围、核算的程序方法以及费用摊销方式还不明确，给医疗中带来了很多由财务管理产生的各种医疗、控制不及时等问题。内部控制是通过工作人员来完成的，财务人员的能力不足或落后于现有的管理理念和管理水平，很容易给控制制度的实施造成阻碍，同时，在内部控制的具体制度制定当中，缺乏实时的补充和完善，缺少具体的控制方法，这也会给内部控制的实施带来影响。
（四）缺乏审计监督机制
任何一个制度的执行都需要相应的审计监督部门来督导实施，而在医院财务内部控制的管理过程总，缺乏相应的内部监督和审计机制，或是缺乏相应的标准和体系，这就使管理工作、审计监督等往往会流于形式。同时，审计机制的缺乏，也会使管理层缺乏相关的约束机制，部门之间、员工之间也没有相应的制衡，给财务内部控制管理带来很大的漏洞，容易出现财务问题。
二、加强医院财务内部控制的措施
（一）提高医院管理层对医院财务内部控制的重视。医院管理层对医院内部控制的认知和高度重视，可以保证医院内部控制的有效实施，也是医院高效管理水平的体现。公立医院承担医疗、教学、科研三方面的艰巨任务，为了医院更好地发展，管理层首先必须加强自身对内部控制的学习，提高自身对内部控制的重视，并把这种重视向中层管理者深化，从而引起全院上下的高度重视。其次，明确医院各部门内部控制制度执行的责任人，建立内部控制的机构，保证医院内部控制的顺利实施。同时，加强对不同层次的内部控制责任人的学习培训，普及内部控制知识，提高工作技能，全面提升各级内部控制人员思想认识和工作水平。
（二）完善医院内部控制制度。在新的医改推进的形势下，按照新的医院会计制度中医院财务内部控制的规定，结合医院实际情况，完善医院的内部控制制度，用明确的制度和规定，指导医院内部控制工作的开展，使内部控制管理工作做到有章可循，以规范化、科学化的内部控制制度保障医院内部控制的高效实施。
（三）创新医院内部控制的管理方法。新形势下医院财务内部控制的实施，不能沿用老的内部控制管理模式。内部控制管理方法由粗放型管理转变为精细化的集约型管理。对于医院开展的项目做到事前精确预算、事中严格控制，事后分析评估，及时发现问题，规避财务风险。医院内部控制的实施，要充分利用信息工具，借助医院HIS系统、财务系统、物流管理系统、固定资产管理系统、人力资源管理体系、成本系统等进行医院内部控制管理，可以加强医院经济运行的监督，更好地控制医院的投资、筹资、设备购置、大额资金收付业务，使医院的内部控制真正落到实处。
（四）加强资金预算管理工作。资金预算管理是医院财务内部控制中的重中之重，贯穿于医院整个运行过程，因此，加强内部控制中的资金预算管理才能提高医院的经济效益，实现医院的综合目标。在资金预算内部控制工作中，首先要以医院的管理目标为出发点，结合医院实际情况，做好事前预测，合理配置预算资金。其次，医院管理层从内部控制制度上赋予财务人员更大的管理权限，对科室的预算资金使用进行指导和监管，做好预算资金内部控制环节中的监督工作。最后对资金预算执行情况做好分析评价，向医院管理层反馈资金预算执行情况，为管理层加强管理提供依据。
（五）加强固定资产管理。固定资产是医院科学有效地开展医疗、科研和教学等各项工作的物质基础，也是医院提高其服务质量的关键物质保障。搞好医院的固定资产管理工作是内部控制工作的基础。医院必须建立健全固定资产的管理制度，明确、界定医院固定资产的申购、招标、验收等过程中的责任，加强对固定资产的科学化管理。医院会计部门必须严格监督和考核固定资产的使用情况，设立定期盘点制度，杜绝固定资产账实不符，避免医院固定资产的流失或者是闲置浪费等情况的发生，最大限度地提升医院固定资产的使用效率，提高医院经济效益。
（六）加强医用高值耗材的内部控制。高值医用耗材作为医疗费用的重要组成部分，其价格的高低直接影响到病人医疗费用的高低。在所有医疗费用项目中，高值医用耗材费用增长速度是最快的，高值耗材的内部控制管理在医院管理占??重要地位。医院应编制合理的需求预算与采购计划，完善高值医用耗材集中采购制度，加强高值医用耗材流通和使用环节价格控制和管理。医用高值耗材的内部控制管理，首先要合理地确定集中采购的范围，采用公开招标的方式，加强集中采购各个环节的监督检查，实行集中采购全过程信息公开。其次，完善高值医用耗材价格监管机制，建立高值医用耗材购销价格公示制度、购销价格监测制度、价格监督检查制度。高值耗材采用条形码管理，高值耗材的内部控制工作可监控到从采购入库、出库到病人使用的全部过程，实时、准确地了解耗材在医院的流通情况。加强医用高值耗材内部控制，有效解决医院在使用高值医用耗材中出现的问题和矛盾，减少医患纠纷，推动国家公立医院改革进程。
（七）加强对内部控制的监督。强有力的监督，可以使医院财务内部控制工作落到实处，提高内部控制工作的效率和公正性。医院应设立专门的监督部门，挑选优秀的专业人才参与监督工作，监督人员应具有较高的专业知识、工作责任心和道德素养，能对财务内部控制的工作进行严密的审查和评价，保证财务内部控制工作为医院做出决策提供最完整、准确的信息数据。
