一、市场竞争与市场定位问题
竞争是市场经济的第一法则，我国又是社会主义市场经济体制，因此农村信用社作为我国金融市场的一个行为主体，参与竞争是不可避免的事情，而其能否在竞争中处于有利地位，那关键就在于能否准确的定位了，因此农村信用社必是跻身于金融市场并参与市场竞争，这便是农村信用社的市场竞争问题与市场定位问题了。有人认为农村信用社只讲竞争就行了，不需要研究定位，这种争论是没有理论根据的。综上所述，农村信用社既要讲竞争，更要讲定位，定位是竞争的手段，竞争是定位的目标。如果没有准确的市场定位，没有固定的客户群体，没有稳固的根据地，就无法参与和赢得竞争。
农村信用社根植于农村，是由社员入股组成、并实行社员民主管理、主要为社员提供金融服务的农村合作金融机构，是农村金融的主力军，与农民唇齿相依，与农村经济的发展息息相通。离开了“三农”经济的发展，农村信用社便成了无源之水，无本之木，因而为社员服务是农村信用社的最根本任务服务于“三农”。农村信用社根植于农村，因此它便有最基础的农业资产，虽说农业资产是弱质产业，也有农业生产本身的自然风险与市场风险，但是它作为国家最基础的产业是受国家保护的，这样以来它也就是比较稳定的产业，因此，以它为基础的(如农村信用)金融业也相对稳定。中国的农业在发展，并以多元化的形式向商品化、专业化、现代化方向发展，因此紧跟着的是农村经济的货币化率也会逐渐提高。
综上所述，农村信用社的定位问题是至关重要的，它直接影响到农村信用社的业务发展问题，我们也可以看出农村信用社定位于“三农”是不容置疑的。
二、农村信用社的风险管理
从信用风险来看，农村信用社的贷款风险要高于银行。首先，农村信用社在贷款时通常不使用常规的抵押方式，因为其借款客户一般是低收入者，无力提供常规抵押品。所以农村信用社不得不采用替代性方式来刺激借款者的还款动机，如借款者一旦违约就对其以后的贷款要求全部予以拒绝，或者采取农户联保的方式。我国农村信用社目前对超过小额信贷的贷款就采用农户联保的方式。这一方式有效的前提是农村信用社必须建立强有力的惩罚机制，以保证借款者对联保的无力或不愿还款的成员承担还款责任。如果惩罚机制过弱，一旦一个借款者不能还款，那么联保的其他借款者出于逆向选择都会停止还款，因为每一成员都担心还款责任会落在他一个人头上。其次，由于农村信用社业务的地域限制和特殊的目标客户群限制，其贷款一般都发放给相对同质的客户，而同质借款者的违约风险具有高度相关性。特别是农户联保贷款，同质的小客户群限制了农村信用社风险分散化的能力。
从治理风险来看，对完全由社员出资构成的农村信用社而言，在农村信用社净资产中，社员股金所占比例很少，在很多地方只占5％左右，而且在农村信用社赖以运转的资本中，股金无足轻重，绝大多数处于所有者虚置状态。因为占绝大多数的积累，作为不可分割的集体财产，同各个社员之间没有现实的财产所有权关系。对于社员来说，无论农村信用社经营状况如何，同社员有明确权益关系的股金都起不了多大作用，而且，也不会给其切身利益带来重大影响。所有者缺位的状况造成农村信用社没有追求盈利和发展的动机，因此农村信用社的内部控制一般较为薄弱，同时成员多把入股看作是获取贷款的途径，而不是投资方式。由此引致的风险很难靠外部监管来补救。
三、规模经营与小额农贷问题
在我国社会主义市场经济条件下，对于一个商品生产者来说大规模的经营是他能在激烈的市场竞争中生存下来的竞争理念，农村信用社作为市场竞争的一个行为主体，也同样需要大规模的经营，因此，我们相当一部分人就会认为：农村信用社定位于农村同样需要大规模的经营，就是说必须得注重集约经营，规模经营，要把大户放在第一位，贷大款，赚大钱。这种说法是错误的，在这里我们有必要对规模经营和小额贷款的关系有个真确的理解。
规模经营是一个总量概念，几个大户可以构成一个大的规模，许多的小户累积起来也同样可以构成一个很大的规模的，汪洋的大海不就是一个一个的小水滴汇聚而成的吗?同样的道理千家万户的小额贷款汇聚在一起不也是一个很大的规模吗?它不也是形成了规模经营，产生规模效益吗?因此说规模经营和小额农贷并不矛盾。贷大户固然有它的好处，但更多的是加大了风险，比如，把一个亿的资金贷给一家企业要比把一个亿分散的贷给十家企业的风险要大。这里就有一个分散风险的概念。小额农贷正是分散贷款风险、控制资产风险的有效方式。另外，小额农贷也是维护社会稳定，加强基层政权建设，密切党群关系的重要纽带。
四、农村信用社行业管理的误区
行业管理既是农村信用社体制赋予的使命，也是农村信用社稳健经营赋予的职责。强化行业管理，有利于农村信用社加快业务发展，改善经营效益，防范金融风险，增强服务功能。但是，有一些农村信用社行业管理部门扭曲强化行业管理的概念，不是为农村信用社提供结算、政策、培训等，而是热衷于管人、管贷、管财，未给农村信用社营造良好的外部经营环境，集中更多的精力于名，利，权，造成一管就死、一放就乱的局面。行业管理是天经地义的，是以间接管理为主，以市场经济管理手段为主而不是直接的单纯的人，财，物的管理。
随着农村信用社改革的深入开展，虽然农村信用社经营状况逐步好转，但是还存在一些不规范的经营管理问题，如不及时处理和化解，将会给农村信用社带来极大的危害，农村信用社改革将达不到预期目标。在全面建设社会主义新农村的伟大征程中，各地农村信用社始终立足农村、农民、农业，坚持面向社区、面向县域经济、面向中小企业的市场定位，支农服务不断改进，改革力度不断加大，资金实力不断增强，信贷业务得到长足发展，经营状况明显改善。
