从财政角度分析，财政国库支付改革是我国财政领域的重大事件，是将所有的财政性资金集中在国库指定的代理开设账户之中，如此一来不仅可以提高财政资金支出的透明度，并且也在一定程度上提高财政资金的使用效益。从当前我国财政国库支付改革的运行过程分析，虽然改革进展比较顺利，并且取得了非常显著的成效，但是从全局出发与思考，仍旧存在非常多的问题。
一、财政国库支付改革中存在的问题
1.预算单位在授权额度上与相关规定不相符
根据相关文件得知，在实施财政国库支付改革的区域内财政资金支付的形式包括两种，分别是直接支付与授权支付，所谓直接支付是由我国财政部门向银行或者代理行签发支付指令，并通过国库单一账户体系将资金下拨到相关的收款账户内。而授权支付则是预算单位在按照财政部门的基本要求下自行签发支付指令，相关的代理行则根据支付指令将资金支付到对应的收款账户之中。从某种角度分析，授权支付的形式与《预算法》《国家金库条例》中的规定不符合，往往会在授权支付之后，因为代理行与国库清算时余额不足会形成财政透支现象。
2.拨款书与印鉴管理存在缺陷
现如今有非常多的地方财政部门的拨款书管理比较松散，且签发的拨款书的编号比较混乱，比如拨款书随意摆放或者出现重复编号的现象。另外，我国财政部门缺乏完善的印鉴管理制度，容易导致国库资金风险出现，对资金安全造成威胁。
3.财政部门难以做到“零余额”
当前有非常多的地区为进一步解决支付瓶颈的问题，很多财政部门会事先在代理行设立“小额现金账户”，从而将国库内的大笔资金预拨到“小额现金账户”之中。另外，在依据预算单位的实际需要中，财政部门集中各支付部门严格按照预算单位的申请资料将款项拨付到劳务者手中，虽然这种支付方式比较简单方便，但是却缺少了国库监督环节，甚至会导致大量的资金滞留在银行内部，长此久往则会形成“第二国库”。
二、财政国库支付如何形成科学化、精细化管理
诚如上文所言，在财政国库支付改革中因受到诸多因素的影响，导致问题层出不穷，无法真正推动财政国库支付改革的有序发展，并且也无法保证资金的安全性。为进一步提高财政国库支付改革的有序发展，则需采取科学化、精细化管理。
1.加强预算编制改革
在新形势下财政资金需打破传统的模式，不再区分预算内外，简而言之便是要将所有的财政资金都积极纳入到预算体系之中，保证国库收支能够对所有的财政收支状况有所了解，这样一来，才能从根本上保证所有的财政收入都被纳入到国库监督范围之内。另外，还需要改变预算年度，由原先的历年制转变为跨年制，由于我国预算年度在1月份，但是大多数审批预算在3月份以后，导致1月份的预算执行缺乏规定。鉴于此，可以采取跨年制，保证全年预算都有法律依据。
2.加强监督与管理
要想从根本上保障财政国库支付改革的稳定发展，那么则需要对预算执行进行控制，可以从制度设计、机制运行以及动态监控等方面构建完善的监督管理体系，加强对资金使用的监督与管理。首先需要进一步深化国库支付制度，并且要在当前实际发展情况下采取有效的措施，进一步深化与优化，以此提高支付效率。其次需要改革监管方式，比如在财政资金的整体运行基础上，可以构建监控、预警、分析、查询为一体的监控系统，加强对预算单位资金支付的监督与管理。
3.加强应用电子化建设
在新时代中信息化建设水平逐渐提高，将信息化技术应用到国库支付制度改革中，能够实现财政、税务、国库之间的资源共享。另外，在国库支付制度的整体运营下需要加强网络的利用，可以构建国库资金银行支付清算系统，或实施财税库银的横向联网，保证国库支付制度在信息化制度的影响下更加完善。
4.构建监控体系
国库支付制度具有强化预算约束的重要作用，能够提高资金的使用效率，但是在发展运行中同样离不开严格的管理制度。我国财政部门需要依据实际发展情况建立预算单位分月用款的计划制度，加强对财政资金的监督与管理，并构建完善的内部监督制约制度。另外，还需加强对银行的监督与管理，实现对代理银行的资金清算以及资信监督，审计部门需对预算执行情况进行检查，保证政府部门与其它预算部门能够依法履行职责。
5.形成政府采购模式
从我国财政角度探析，国库支付制度与政府采购支付是相辅相成的，均是公共支出管理的重要组成内容，一般情况下国库支付制度能够引发联合套取财政资金的行为，但是如果采取政府采购制度，才能真正避免违法乱纪现象的发生与出现。
三、结语
总而言之，财政国库支付制度关系到资金的安全性，当前国库支付存在非常多的问题，不仅包括本文所讲述的内容，还包括审批环节多、时间久、系统不成熟等，为进一步提高我国财政国库支付改革的创新发展，相关财政部门则需要树立服务观念，并针对性的采取相关的措施，积极完善监控体系，并对系统版本进行审计，在落实网络安全措施的同时也保证财政国库支付的安全性。另外，还要不断强化国库支付服务，为我国预算单位提供优质服务。
