对政府投资项目进行跟踪审计，能够为政府科学合理的投资决策提供重要的依据，能够降低政府资金的浪费，增强资金的有效使用。并且还能实现建设项目的规范管理，规避腐败行为，减少经济犯罪率。但是由于政府投资项目跟踪审计是近年来形成的新生事物，实践中还存在一些问题，需要我们深入分析和解决。
一、政府投资项目跟踪审计中存在的问题
1.跟踪审计有关法律法规不健全
由于跟踪审计是近年来形成的一种审计监督模式，因此当前缺乏匹配的法律法规及规范，并且也没有充足的审计依据和明确的衡量标准，审计质量停滞不前。尤其在一些共性的问题上，没有统一的实施标准和做法。跟踪审计内容、程序、审计报告等均不够规范，致使跟踪审计存在明显的主观性和随意性，制约了审计的独立性和权威性，审计部门常常陷入被动的状态，达不到预期的审计质量要求，给审计风险带来了可能。
2.单位存在认识偏差，审计环境不佳
当前，跟踪审计在基层审计机关中还处于探索发展阶段，由于跟踪审计实际牵涉了设计、建设、施工、监理等各部门，不仅项目施工单位多，再加上审计宣传力度不强，缺乏有效的审计措施，相关部门忽视了跟踪审计的重要性，将跟踪审计与跟踪监视混为一谈，认为跟踪审计的任务是控制施工部门的付款，所以相关部门会刻意逃避一些核心环节的审计监督；再加上现代法制环境、社会环境、工作环境对跟踪审计存在一定的影响，加大了跟踪审计的运行难度。
3.审计人员专业素质不高，审计风险加大
跟踪审计涉及领域较广，责任繁重，要求严格，从事跟踪审计工作的人员大多是非专业出身，综合素质普遍不高，并且所拥有的专业技能达不到跟踪审计的要求。此外，由于跟踪审计的服务对象多是施工企业，而这些企业为了达到自身的利益需求，通常采用一些偷工减料的、高估冒算等手段来获取不正当的利益，这样审计人员工作中就会遭遇各类障碍与压力。再加上审计内部复核人员对工程技术审计方面的知识了解不透彻，审计质量控制也潜在严重的风险。
二、加强政府投资项目跟踪审计监督的措施
1.构建完善的项目跟踪审计法规制度
依法审计是审计工作有效开展的前提保障，只有通过构建完善的法律法规才能奠定跟踪审计，为跟踪审计提供有利的法律依据，才能保证建设项目跟踪审计的全面开展，从而实现预期的审计目标。当前，上级审计机关应尽快制定行之有效的《跟踪审计操作规程》《跟踪审计监督办法》等标准要求，构建一套科学完善的规章制度，促进跟踪审计向规范化、程序化、制度化方向发展。
2.营造良好的审计环境，充分认识跟踪审计的重要性
审计部门应大力推广与宣传跟踪审计工作，提高建设单位对审计监督重要性的认识，积极主动地接受审计监督，营造有利于跟踪审计工作发展的外部环境。并且还要加强执法，树立正确的审计形象，对资源进行优化整合监督，以形成监督合力，督促相关管理部门做好设计、施工、监理等各环节的管理，构建相关的制度，明确划分各自的职责权限，齐抓共管，提高各部门的认识程度，从而共同努力完成审计工作。
3.培养一批优秀的审计人才，加强培训
为了确保审计人员数量达到审计任务要求，应加快培养一批优秀的审计人才，优化审计机构，理顺体制，设置完善的投资审计机构，公开招聘专业的审计人员，落实投资审计的优惠政策，全面发挥审计的独立性和权威性。加大投资审计人员的培训力度，鼓励审计人员参与相关资质与职称考试，以不断丰富自身的财务审计和建设工程审计，争做各方面能力都很强的复合型人才。
4.将工程造价审计与财务审计有机结合
工程与财务之间属于彼此验证的关系，工程中存在的可疑问题，以财务审计为切入点，通过财务支出得到证实，若工程财务中存在可疑问题，也可从工程造价中得到证实。所以将工程造价与财务审计有机结合，对投资全面审计具有重要意义，充分反映了投资审计的重点，这是投资审计分析由定性转向定量为主的重要手段。如果只注重一个方面，未将两者有机的结合，那么就会给投资审计带来巨大的局限。所以必须注重两者的结合，才能优势互补，共同发挥作用。
5.全面控制工程建设项目动态信息
跟踪审计主要对整个工程建设项目进行审计，实际上其根本目的在于全面控制工程建设项目动态信息，结合具体的动态信息明确所要审计的环节与事项。加强跟踪控制工程建设项目动态信息，能够及时有效的审计工程建设质量、工程款项支付情况等环节。实际中，审计组与审计人员在进行跟踪审计项目时，应严格要求建设管理单位提供详细的工程建设进度情况、信息、资金款项支付情况，以及核心变更事项等。审计组应将控制工程建设项目动态信息和关键环节事项审计有机结合，从而科学控制工程造价。
三、结论
综上所述可知，政府部门应根据审计工作的实际进展情况，制定有针对性的跟踪审计规章制度，科学确立跟踪审计范围，加强各部门间的协作等，为跟踪审计工作提供有利的法律依据。此外，审计部门根据规章制度，编制规范的跟踪审计操作流程及实施细则，为跟踪审计工作提供科学的指导，从而确保跟踪审计工作的持续健康运行。
