为适应公共财政管理体制和军工科研事业单位市场化改革的需要，财政部于2013年12月修订并发布了《军工科研事业单位会计制度》（以下简称“新会计制度”）。新会计制度与2012年12月修订颁布的《军工科研事业单位财务制度》共同构成了军工科研事业单位全新的会计核算制度体系。新会计制度增加了更趋同于企业会计准则的规定，兼顾了军工科研院所核算体系的特殊性与市场化的需要，有效解决了旧制度在会计核算和报表编制中存在的脱节问题，但在实际执行中仍不可避免出现一些新的问题。
一、新会计制度对实务的主要影响
（一）完善了会计核算体系。新会计制度规定基建投资应单独核算，并按月进行并账处理。这改变了基建账务长期游离于大账之外的情况，使得军工科研事业?挝徽宋窈怂闾逑岛褪乱当ū硖逑档靡酝晟啤Ａ硪环矫妫?新会计制度引入了国库集中支付核算体系，将财政补助经费的确认、支出和结余单独核算，有效理顺了中央部门预决算报表管理和会计账务的衔接。
（二）强化了国有资产管理。新会计制度强化了国有资产管理的要求。如设立非流动资产基金，将净资产中基金制模式管理的范围从固定资产延伸到无形资产和在建工程；对国有资产采用“收支两条线”管理，国有资产出售所得的净收益属于国家所有，需上缴国库；处置长期股权投资需通过“待处理资产损溢”科目归集，对应基金减少部分需上缴国库等。
二、新会计制度存在的问题分析
（一）事业单位固定资产投资需求受专用基金规模限制，导致专用基金出现赤字。新财务制度规定，军工科研事业单位自筹资金投资固定资产的唯一来源是“专用基金―折旧基金”，原则上不允许超出基金规模开展固定资产投资。但在执行过程中，由于规定的固定资产折旧年限较长，“专用基金―折旧基金”积累速度缓慢，另一方面，随着近年来单位发展的需要，自筹资金形成的固定资产投入需求不断加大，导致“专用基金―折旧基金”出现赤字，无法满足科研事业单位开展投资业务和拓展研发能力的现实需求。
（二）将负债性质的财政补助结转和结余划归为净资产，扭曲了真实的负债水平。新制度设置了“财政补助结转”和“财政补助结余”科目分别核算财政资金阶段性结余和项目完工后资金结余。财政补助结转资金在后续年度继续开支使用，结余资金根据情况上交国库。从核算业务的经济性质来看，两科目核算内容应属于负债类，而非净资产。特别是原先计入专项应付款的财政拨入基建资金如今计入财政补助结转，作为净资产列示，会造成事业报表资产负债率大幅波动，不利于真实反映单位的负债水平。
（三）职工福利费的划分界定不清。新会计制度规定用于职工个人福利的支出应通过“应付职工薪酬――应付福利费”科目归集后，计入相关成本费用科目，而职工福利基金则用于集体福利支出。旧制度下，职工福利费采取“先提后用”的做法，然而，每年实际支付的福利费用远远达不到计提额，实际上虚增了成本费用。新制度与企业会计准则趋同，规定职工福利费据实列支，是符合收入成本匹配原则的。但制度未对个人福利与集体福利的界定进行明确，负债类科目和权益类科目的划分规定过于笼统，实务中需依赖会计人员的职业判断，存在盈余管理的空间，影响会计信息准确性。
（四）事业报表转换企业报表过程中出现新的问题。新制度规定大型设施维护费在收到拨款时直接结转事业结余。在转换为企业报表时，这部分结余不能形成利润，却增加了所有者权益，既不属于经营积累也不属于所有者投入的资本，与企业会计准则相矛盾，造成了报表勾稽关系的混乱。转换为企业报表后，实收资本等于事业基金中资本性国有资本金拨款以及非流动资产基金中国拨部分对应的资产原值。这一规定常导致实收资本、EVA、净资产收益率等指标在不同会计期间大幅波动，尤其是对于基建项目国拨投资较多的基础科研院所，不能真实反映净资产水平，影响报表信息的可比性。
三、政策建议
（一）允许军工科研事业单位使用其他来源进行自筹投资或在决算中如实反映“专用基金”赤字的情况。允许有经济承受能力的单位比照企业适当提高折旧计提比例，允许对更新换代较快的固定资产采取加速折旧法，改变现行仅按房屋建筑物与仪器设备对固定资产简单分类的办法，细化不同类别固定资产的折旧年限。
（二）对财政补助结转、结余科目进行重分类，真实反映财政结转、结余资金的经济性质。
（三）对集体福利与个人福利的划分、职工福利费的列支范畴等实务操作中遇到的困惑出台详细的解释细则，避免会计人员依靠职业判断随意处理，影响会计信息的准确性。
（四）央企下属军工科研事业单位具有既从事科研活动又从事生产经营活动的特点。随着事业单位分类改革的推进，大量科研院所将逐渐增加经营业务的比重、引入多元化资本渠道。军工科研事业单位会计制度应加快适应军工科研院所发展和改制的趋势，逐步向企业会计准则趋同。
