内部会计控制制度是现代化企业管理的重要组成部分，也是企业生产经营活动赖以顺利进行的基础。内部会计控制制度是运用系统理论和方法，按照单位所属各个控制系统建立的，是企业内部控制的核心内容。只要严格遵循内部会计控制制度的原则，并采取适当的步骤与方法，就能将内部会计控制制度建立起来。
首先，要对单位内部结构和外部环境展开调查。任何一个单位总是处于一定的经营环境之中，经营环境的变化必然会对单位形成一定的外部机会与外部威胁。这些外部环境主要包括政治、经济、文化、人口、技术等。尽管外部机会与威胁不在单位内部控制范围之外，但在设计内部会计控制制度前必须对此有所了解，这样制定出的内部会计控制制度才能有效规避外部风险，实现内部会计控制的目标。
同时对本单位的经营方式、组织体系，资金、物资、设备、技术的状况，信息沟通和管理过程等情况也了解清楚，并有针对性地制订和加强会计控制制度，才能发挥作用和效力。
其次，要划分单位内部结构。一般而言，单位内部结构可划分为行政领导体系、构成要素体系、经营体系和管理体系等四个系统。这四个系统的组成部分和内容又划分为若干所属的子系统。如行政领导体系可分为董事长、总经理、各个职能部门和分支公司经营的所属系统；构成要素体系可分为人力、资金、物资、设备、技术、信息沟通的所属系统；经营体系分为销售、采购、生产、储运、运输等系统；管理体系可分为会计、统计、审计、电子监控、电脑管理等系统。当然，还可细分，如内部会计控制系统又可分为现金、银行存款、有价证券、应收货款、固定资产、无形资产、债权、债务、资本、成本、费用、利润等控制系统。
根据划分的各个所属控制系统，将系统运行过程中的关键环节确定下来，作为内部控制要点；同时找出每一个关键环节控制要点的有效方法和操作规范，将各个环节按照先后活动的过程次序进行编排，予以连接起来，就可以制定出一个完整的程序。
再次，要划分合理的职责。合理的职责划分，可以防止、发现或纠正不正常情况的出现。对会计工作涉及的各项职责进行合理的划分，是使每个人的工作能自动地相互检查另一个人或更多人的工作。判断职责划分是否合理，主要是看能否及时地发现某一员工在履行其职责过程中可能出现的错误和舞弊行为。在进行职责划分时应注意两点：第一，应将处理每一笔业务的全过程分为几个环节或几个步骤，然后将一笔业务执行包括的各个环节指派不同的人员或部门分别完成。如销售业务，应将销售的授权审批、货物的发运、销售发票的开具等工作分派给不同的人员。完成任何一项业务都要有两个或两个以上的人员或部门共同进行，同时又相互牵制。不同人员或部门的相互协作和相互监督就可以防止不正常情况的出现，一旦出现也能及时发现并纠正。第二，在职责的划分中，应注意不相容职务的分离。如一项业务的授权、执行以及相关资产的保管应指派不同的部门或人员。如采购部门人员负责货物的采购，会计部门应记录已收到的货物，仓库应负责该货物的保管工作。在记录该项采购交易前，会计人员应确定采购是否经过授权审批，所订购的货物是否已实际收到。同时，会计记录又为明确存于仓库货物的受托责任提供了依据。在手工会计系统，应收款总账与明细账应有不同的人员来记录，而记录现金收入和支出的人员不应负责调节银行账户等。
最后，形成内部会计控制制度。在确定程序、方法、职责和操作规范后，要将内部会计控制制度的各项原则贯彻到各个有关控制系统的程序、方法、职责和规范中去，用文字形式分别在有关的内部会计控制制度中予以说明。这样，就能够形成一整套严密的内部会计控制制度管理体系。
建立内部会计控制制度，是单位，特别是企业经营管理体制的重要组成部分。严密的内部会计控制制度对于防止单位舞弊的发生、保障资产安全、改善经营管理等具有十分重要的意义，也是单位经营管理的内在规律。在建立内部会计控制制度时，除了要坚持基本原则、步骤、方法外，还应当注意下列事项：
一是一切从实际出发。要根据单位的行业经营特点、经营性质、规模大小、经营方式、人员机构情况等，综合考虑建立内部会计控制制度，不能千篇一律，生搬硬套。
二是善于运用系统论的方法。必须在充分调查单位内部结构和经营管理状况的基础上，运用系统理论和方法，对内部结构分成几个系统及若干个更小系统进行适当分类，形成一个完善的内部会计控制体系。
三是条理清晰。内部会计控制制度的文字说明要简洁明了，条理清楚，使人一看就懂，容易记忆、掌握和执行。
四是各控制要点要全面，不能有遗漏、重叠。如有遗漏，必须重补。对程序的各个活动环节不宜分得太细，太细显得繁琐，不利于建立和执行。
五是不能搞形式主义。建立内部会计控制制度后，必须立即组织实施，严格执行，不能流于形式。单位负责人和中高级管理人员要带头遵守，员工自觉遵守。
六是实现纪律控制。在执行过程中，要组织相关职能部门定期或随时检查执行情况，实行纪律控制。对发现有不严格执行、违反制度的，应当及时采取措施予以制止；发现内部会计控制制度有不完善、不严密、或不适合单位经营发展要求和实际情况的，应对制度加以修订。
