营业税改增值税在我国全面推开，是自1994年税制改革以来，又一次深刻的变革。在公立医院财务管理方面，其会计核算、科研经费管理以及税负水平都受到了不同程度影响。
一、营改增对医院会计核算的影响
《医院财务制度》把医院收入划分为医疗收入、财政补助收入、科教项目收入、其他收入四部分，其中，医疗收入、财政补助收入和财政拨入的科教项目收入属于医疗活动收入，享受免征增值税的优惠政策，而医院从事的非医疗活动取得的其他收入，均应按规定征收各项税收。营改增以后，为适应增值税的核算，医院应设置“应交增值税”科目，其下设“进项税额”、“销项税额”、“已交税金”、“未交税金”等明细科目，由此可见，营改增后医院的会计核算趋于复杂，这无疑给医院的财务人员带来了新的挑战。
二、营改增对医院科研经费管理的影响
大型公立医院，尤其是大学附属医院，强调医疗、教学、科研三位一体全面发展，科研经费项目繁多。根据科研经费项目资金来源渠道的不同，科研经费分为横向经费和纵向经费。纵向经费来源于国务院各部委及各级地方政府，如发改委、科技部，属于财政性资金，是不征税业务；而横向经费来源于企事业单位或社会团体，属于医院缴纳增值税的应税业务。
（一）对横向经费入账金额的影响
案例一：某医院课题组从W公司取得10万元科研经费用于科技咨询服务。
营改增以前，由于营业税是价外税，医院确认的会计账面收入与科研经费收入一致，都是10万元。营改增以后，由于增值税是价内税，医院确认的会计收入=科研经费收入/（1+6%）=10/1.06=9.43万元，差额0.57万元确认为增值税销项税额。
（二）对横向科研项目成本的影响
科研项目成本包含劳务费、差旅费、会议费、实验外协费、技术引进费等，其中劳务费、差旅费所占比例较大。然而，劳务费、差旅费不能取得增值税专用发票，不能产生增值税进项税额对销项税额进行抵扣，这势必会影响到医院的科研项目成本管理。由此可见，积极控制劳务费、差旅费在科研项目成本中的比例，重视增值税进项税额抵扣管理，对降低横向科研项目的成本意义重大。
三、营改增对医院税负水平的影响
营改增的目的之一是减轻企业的税收负担，但对于大型公立医院来说，营改增可能导致医院的税负不减反增。
案例二：某医院招收一批进修医生，取得进修费收入230000元。
营改增以前，进修费收入开具营业税发票，适用文化体育业3%的税率，同时，企业在申报营业税时缴纳城市维护建设税和教育费附加，市区的城建税、教育费附加、地方教育费附加适用的税率分别为7%、3%和2%，会计处理如下：
取得收入时：
借：银行存款 230000
贷：其他业务收入 230000
缴纳税费时：
借：管理费用 7728
贷：应交税费-应交营业税
6900（230000*3%）
-应交城市维护建设税
483（6900*7%）
-应交教育费附加
207（6900*3%）
-应交地方教育费附加
138（6900*2%）
营改增后，医院的进修费收入开具增值税发票，适用的税率为6%，由于增值税是价外税，会计处理如下：
取得收入时：
借：银行存款 230000
贷：其他业务收入
216981 {230000/（1+6%）}
应交税费-应交增值税（销项税额）
13019
缴纳其他税费时：
借：管理费用 1562.28
贷：应交税?M
-应交城市维护建设税
911.33（13019*7%）
-应交教育费附加
390.57（13019*3%）
-应交地方教育费附加
260.38（13019*2%）
在不考虑成本和增值税进项税额的情况下，营改增以前，医院确认的其他业务收入为230000元，收支结余为222272元；营改增以后，医院确认的其他业务收入为216981元，收支结余为215418.72元，由此可见，收入和收支结余都减少了，医院的税负出现了不减反增的现象。
四、应对营改增的具体策略
（一）加强税法政策的宣传
作为营改增工作开展的主体，全院人员对营改增的态度十分重要，医院在优化管理，改革制度的同时，更应注重对全院人员进行营改增政策的宣传、培训。公立医院可通过宣传各项税收政策，举办专场培训，保证相关人员对营改增清楚的认识，财务人员更应该积极主动的了解相关资讯，主动建立学习小组，保证财务团队的专业化。通过开展一系列相关的宣讲活动，提高大家对营改增的认识，并利用宣传板、办公OA系统、LED大屏等多种形式向医院广大医务工作者传递营改增政策热点，营造良好的文化氛围。
（二）细化调整会计科目
事实上，医疗收入是免税的，但随着社会发展，医院规模逐步壮大，医院总收入中，非医疗收入不论是在整体收入比例上，还是数量上都不可忽略，而非医疗收入根据我国相关税收法律制度，是必须要纳税的，所以作为纳税主体，公立医院有着十分特殊的性质，即具有应税收入和非应税收入并存的特点。可以说，应税收入和非应税收入的界限清晰划分，是衡量公立医院财务管理的重要指标。
根据财务核算的需要，在科教项目收入下设置“应税经费收入”、“非应税经费收入”明细科目，在其他收入下设置“应税收入”、“非应税收入”明细科目，相应的支出科目也应设置应税与非应税明细科目。医院根据增值税特点，调整自身会计核算系统，对应税业务进行标识，这样可保证相关人员办理业务或进行数据分析时能够清晰的加以区分。另外，通过对医院财务人员的培训，避免应税与非应税业务之间的混淆。
（三）加强票据管理，做好纳税筹划
增值税发票分为普票（增值税普通发票）和专票（增值税专用发票），其最大区别在于是否可进行进项税额抵扣，在非医疗活动中，如科研经费，一些大型附属医院财务部门，要面临大量的增值税代缴工作，而医院是按照预算进行开支的，不能垫付税金，科研人员只能自己先垫付税金，这严重影响科研工作开展。而医院在购入设备时，选择提供专票的采购商，可抵扣进项税款，享受政策福利。所以医院要逐步加强增值税业务管理，设立专门机构，保证税务工作的全面、清晰、
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