水利经济自20世纪70年代初被提出综合经营到现在，已经涵盖了水资源开发利用的各个方面。三峡工程、南水北调等重点工程建设和全国防洪规划、全国水资源规划等重大规划的编制工作在水利经济科学的强有力技术支撑下都取得了极大的成功。
纵观我国水利经济的发展，发现水利经济面临以下几个问题：一、水利企业在选择和开发水利经营项目时多由于考虑眼前利益将项目依托业主，忽略了水利经济的可持续发展。二、水利企业受到规模和主营业务交叉重复的限制，容易造成企业间的竞争杂乱无章，导致经济结构的不合理。三、水利企业以原有事业单位为基础建立发展而成，容易导致出资人不到位、产权模糊的状况。四、水利经管部门的财政收入不足，在一定程度上对水利经济的良好发展产生了较大的影响。
水利经济在作为资源经济的同时也应当被视为市场经济，在思想上的解放对于水利经济发展有着极大意义。这种思想转变应当引起相关水利部门的认可和重视，从而使相关部门意识到水利经济科学发展的重要性。与防汛抗旱以及水利建设一样，水利经济的建设具有建设性的意义。促进水利经济科学发展的关键在于需要将政府补贴和有偿服务相结合，采用统筹兼顾法，采取合理政策，加强技术人才和管理人才的培养，同时要提高科技含量，从而促进我国水利经济又好又快发展。
一、政府补贴和有偿服务相结合
政府补贴和有偿服务相结合，是全球范围内广为使用的政策。水利是农业发展的命脉所在，也是国民经济的命脉之一，在整个社会的发展中都起着巨大的作用。水利经济在作为资源经济的同时也代表着市场经济。水利工程对于政府部门而言，社会效益远高于财务收益。但是单靠水利部门所取得的财务收益来支撑水利经济的可持续发展是极其困难的。在使水利工程最大程度增加效益的同时，应当给予一定的政府财政补贴，可在水利工程完工后从税收中提出一部分补贴水利行业，以保证水利工程的良性发展。除此之外，可根据受益程度，对为水利工程服务的对象收取在可接受范围内的水费和电费、防洪费等。
二、采用统筹兼顾法
鉴于水利工程的监管部门规模不一，在水利工程建设之时就可采用统筹兼顾的方法。在满足我国经济发展需求的同时，有意识地加强财务收入不同的各个部门之间的配合和共同建设。在水利工程获得社会效益的同时使财务收益分配合理化，这样有利于促进水利经济的科学发展。此外可一定程度上改善水利管理机制，如建立和完善激励机制、竞争机制以及融资机制等，在获得经济利益的同时也可使水资源得到充分合理的利用，将会对水利经济科学地发展起到促进作用。
三、采取合理政策
制定经济政策以促使各个水利部门实现科学发展。在水利工程的财务收益中，由于不同部门的财务收入情况有所差异，在水利建设的过程中应当统筹兼顾，根据不同部门的具体情况，实施相应的政策，并且给予各个部门不同的政策扶持。即在对各个部门的社会效益和经济效益进行有效评估之后，可根据各地的实际经济情况以及所受益对象的承受能力的差距，确定相应的经济扶持政策。根据经济发展的程度，以分批次的方式将政策落实下去，逐渐减少政府在经济富裕区域的财政补贴，相应地加大政府财政补贴在经济困难区域的投入。在提高国家经济利益的同时，有效合并整个水利行业的建设和管理，综合利用各处资源，也能提高水资源的合理使用。
四、加强技术人才和管理人才的培养
在对水利经济科学的技术人才和管理人才等人力资源进行整合的同时，应当加大对其技术培养和道德教育力度，从而提高相关人员的综合素质水平。建立相应的科研攻关团队对于提高科技人员的专业素养有着极大帮助。在提高科技人员专业素养的同时也应当注重对于人才的有效管理。水利系统造就了大批技术人才，但经营管理人才屈指可数。结合水利经济科学的实际情况，可有选择地引进相应的管理人才，在工程、旅游、会计、经济、外语以及法律等各个方面对其进行培养，提高其思想认识水平，从而引导和带领全体职工重视水利经济的发展。在建立尊重知识、尊重人才、创造人才成长的新体制和机制时，可建立相应的激励措施，留住技术人才和管理人才，推动水利经济的科学发展。
五、提高科技含量
水利经济科学发展要将依靠经验转变为依靠科学技术生产和提高相关人员的综合素质上，认真贯彻落实科教兴水的措施。在依托水利系统在水利资源方面的优势之外，要依靠科技技术的进步提高产品优势，将资源优势转变为行业发展优势。加快水利科技开发，实行产、学、研一体化，从而实现低投入、高产出的良性循环。
六、结语
促进水利经济科学发展，要在将政府补贴和有偿服务的有机结合的同时，采用统筹兼顾法，采取合理政策，加强技术人才和管理人才的培养，同时要提高科技含量，从而促进我国水利经济又好又快发展。
